Övergreppet skedde i kvinnans bostad och den 29-årige mannen höll en hand för hennes mun för att hindra henne att skrika, skriver åklagaren i sin stämningsansökan.
Förundersökningen är hemligstämplad eftersom det handlar om ett sexualbrott. Av stämningsansökan framgår dock att kvinnan har ett handikapp som gör att hon inte kunnat försvara sig mot 29-åringen.
Det finns också teknisk bevisning i form av sängkläder och en madrass, som tagits i beslag för att visa att övergreppet ägde rum i kvinnans sovrum.
Våldtäkten inträffade i slutet av april i en lägenhet i centrala Eskilstuna.