Utspelet i brevform från katolska kyrkans biskopskonferens gjordes på fredagen, då man i ovanligt skarpa ordalag kritiserade hur en regimkritisk demonstration slagits ned den 31 juli.
I kommentaren sade kyrkan att sociala och ekonomiska problem skadar landet.
Informationsminister Monica Mutsvangwa säger att brevet var skrivet av "ondskefullt" kyrkligt ledarskap, kritik riktat främst mot ärkebiskop Robert Ndlovu.
Hon jämförde biskopsrådets brev med utspel som gjordes av en kyrklig företrädare i Rwanda strax före folkmorden på tutsier och moderata hutus 1994. I Zimbabwe råder spänningar mellan folkgrupperna ndebele och shona.