Det är den högsta dagliga siffran sedan de första fallen registrerades i mars.
Enligt hälsodepartementet har nu 15 515 fall bekräftats. Västra Kapprovinsen, där Kapstaden ligger, är värst drabbad med nästan 60 procent av alla fall i landet.
Hittills har 263 människor avlidit i sviterna av covid-19, en ökning med tre sedan lördagen.
Afrikas mest industrialiserade land har även flest fall på kontinenten. Landet är nerstängt sedan den 27 mars och satsar på omfattande testning, med över 460 000 prover tagna. En del experter har dock börjat ifrågasätta strategin med masstestning, där det kan ta upp till två veckor att få provsvaren.