Första halvlek blev mållös, men direkt efter pausen slog Yahye Abdirahman Aden till och gav Flens FF ledningen.
I 52:a minuten slog Yusuf Ali Yusuf till, och gjorde 2-0.
Till slut kom också 3-0 genom Yusuf Ali Yusuf i 63:e minuten.
Flens FF ligger på fjärde plats i tabellen efter matchen, medan Marsjö Byle ligger på sjätte plats.
Nästa motstånd för Flens FF är Julita. Lagen möts söndag 18 maj 15.00 på Öljevi IP-A.