I natt valde Bowman också att kliva av uppdraget som general manager för USA:s ishockeyherrar i OS i Peking nästa år.
"I ljuset av vad som hänt tror jag att det ligger i USA Hockeys bästa att jag stiger åt sidan", säger han enligt ett pressmeddelande från det amerikanska ishockeyförbundet.
Stan Bowman och andra ansvariga i Chicagos ledning ska ha blundat för anklagelserna och låtit bli att polisanmäla tränarens övergrepp som inträffade 2010.
USA:s ishockeyförbund söker nu en ersättare till Bowman. Sedan tidigare är det klart att Pittsburghs Mike Sullivan blir huvudtränare för USA i Peking.